Microscopia

Panoramica

Il laboratorio fornisce attrezzature di imaging all’avanguardia e solide competenze per i progetti di ricerca più impegnativi, dagli eventi subcellulari alla dinamica cellulare negli organi. IRB offre inoltre supporto e formazione individuale per studenti, ricercatrici e ricercatori.

Manager

Diego Morone
diego.morone@irb.usi.ch
+41 58 666 7039

Strumenti

Microscopio confocale e a super risoluzione
- Leica Stellaris 8 STED FLIM, completamente equipaggiato con un laser 405nm e un laser a luce bianca (tutte le linee laser 440nm-790nm), 5 rivelatori ibridi di nuova generazione (tecnologia Power HyD Leica), stadio piezoelettrico z per l’imaging 3D veloce di cellule vive, scanner risonante, obiettivi con correzione dell’aberrazione per l’imaging ad alta risoluzione come 100X 1.4 oil e 93X 1,3 glicerolo, modulo STED con laser a deplezione da 660 nm e 775 nm per una super-risoluzione fino a 30 nm su tutti gli assi e modulo FLIM lifetime.
- Leica Stellaris 5, equipaggiato con un laser 405nm, 440nm e un laser a luce bianca (tutte le linee laser 485nm-790nm), 5 rivelatori ibridi di nuova generazione (tecnologia Power HyD Leica), tavolo motorizzato e stadio piezoelettrico z per ricostruzioni rapide di grandi campioni in 3D.

Sistema di screening ad alto contenuto
- Molecular Devices ImageXpress Micro 4, microscopio automatizzato con 5 canali di fluorescenza e luce trasmessa. Il microscopio è abbinato a un robot per l’acquisizione e l’analisi automatizzata di un massimo di 45 piastre. Il software consente una semplice impostazione dell’acquisizione e fornisce moduli per la segmentazione e l’analisi.

Microscopi a fluorescenza
- Microscopio dritto Nikon Eclipse E800.
- Microscopio invertito Nikon Eclipse TE300, con incubatore per esperimenti su cellule vive e microiniettore Eppendorf FemtoJet.
- Microscopio invertito Zeiss Axiovert 200, dotato di ottiche con correzione UV e software TILLvisION per gli esperimenti di misurazione raziometrica del calcio.

Microscopio multifotone
- LaVision BioTec TriM Scope combina un microscopio dritto e uno invertito, dotati di due laser infrarossi pulsati sintonizzabili e OPO per l’imaging simultaneo multicolore su un massimo di 5 canali.

Postazioni di analisi
- Analisi Imaris con 2 CPU Xeon E5, 256 GB di RAM e GPU AMD Radeon R9 200.
- Server MetaXpress Powercore per l’analisi in batch dei dati ImageXpress.
- Server di imaging Linux con GPU NVIDIA RTX 2060 per l’analisi delle immagini basata sull’intelligenza artificiale.

Con questi sistemi possiamo eseguire la maggior parte delle procedure di imaging di cellule e tessuti, come STED, imaging rapido di cellule vive, FRAP, fotoconversione, FLIM-FRET e ricostruzione 3D su tessuti anche chiarificati. Le immagini ottenute con queste tecniche possono anche essere combinate con micrografie di microscopia elettronica in microscopia elettronica correlativa (CLEM).

Supporto

Formazione individuale su tutti gli strumenti.
Assistenza nella progettazione sperimentale.
Assistenza durante l’intero esperimento, dall’acquisizione all’analisi delle immagini.
Software utilizzati per l’analisi delle immagini:
- Open software: ImageJ/FIJI, R, CellProlifer
- Commercial software: Autoquant X3 (Media Cybernetics), MATLAB (MathWorks), MetaXpress (Molecular Devices), Imaris (Bitplane), Aivia Go (Leica)

Corsi

Fondamenti teorici della microscopia per applicazioni biologiche (organizzato dal prof. Marcus Thelen)
Analisi delle immagini (organizzato da Diego Morone)

La facility è aperta a collaborazioni per lo sviluppo di nuovi strumenti, tecniche e software di analisi. Un esempio è LysoQuant.

LysoQuant

LysoQuant è un software per la segmentazione e la classificazione di immagini a fluorescenza che catturano il processo di endocitosi (processo di degradazione e digestione di macromolecole endogene e molecole estranee).

Inizialmente progettato per le esigenze del gruppo di ricerca dell’Istituto, un articolo sul software LysoQuant è stato pubblicato in Molecular Biology of the Cell ed è disponibile per il download.

Per ulteriori informazioni, fare clic qui

Istituto di Ricerca in Biomedicina

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